Protein–RNA interactions for Protein: Q9R060

Nubp1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp1Q9R060 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nubp1Q9R060 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nubp1Q9R060 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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