Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sh2d3cQ9QZS8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms