Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rnf4Q9QZS2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rnf4Q9QZS2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms