Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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