Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Copg1Q9QZE5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms