Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ercc4Q9QZD4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms