Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vps29Q9QZ88 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms