Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Phtf1Q9QZ09 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Phtf1Q9QZ09 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms