Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ03

Slc39a1, Zinc transporter ZIP1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc39a1Q9QZ03 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc39a1Q9QZ03 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc39a1Q9QZ03 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms