Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VapbQ9QY76 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VapbQ9QY76 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms