Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Irx4Q9QY61 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms