Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cbx8Q9QXV1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cbx8Q9QXV1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms