Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip4Q9QXN3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trip4Q9QXN3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms