Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Lsm4Q9QXA5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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