Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Homer2Q9QWW1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms