Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PolkQ9QUG2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms