Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hdgfl3Q9JMG7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hdgfl3Q9JMG7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hdgfl3Q9JMG7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hdgfl3Q9JMG7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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