Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nkain4Q9JMG4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nkain4Q9JMG4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkain4Q9JMG4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkain4Q9JMG4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkain4Q9JMG4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkain4Q9JMG4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkain4Q9JMG4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkain4Q9JMG4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nkain4Q9JMG4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkain4Q9JMG4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nkain4Q9JMG4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms