Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rabgef1Q9JM13 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rabgef1Q9JM13 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
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