Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cabp1Q9JLK7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cabp1Q9JLK7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms