Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tlr5Q9JLF7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tlr5Q9JLF7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms