Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot9Q9JKY0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot9Q9JKY0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms