Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Upk3aQ9JKX8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Upk3aQ9JKX8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms