Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Scamp4Q9JKV5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scamp4Q9JKV5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms