Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Irx5Q9JKQ4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms