Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nectin1Q9JKF6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms