Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trem1Q9JKE2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trem1Q9JKE2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms