Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ybx3Q9JKB3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ybx3Q9JKB3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms