Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uchl3Q9JKB1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Uchl3Q9JKB1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms