Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cnga3Q9JJZ8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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