Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms