Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sh3bgrlQ9JJU8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sh3bgrlQ9JJU8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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