Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms