Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smad9Q9JIW5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smad9Q9JIW5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms