Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Lmbr1Q9JIT0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmbr1Q9JIT0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms