Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pus3Q9JI38 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pus3Q9JI38 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms