Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHX2

Sp5, Transcription factor Sp5, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp5Q9JHX2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Sp5Q9JHX2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sp5Q9JHX2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms