Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
EefsecQ9JHW4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
EefsecQ9JHW4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms