Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rb1cc1Q9ESK9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
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Rb1cc1Q9ESK9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
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Rb1cc1Q9ESK9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
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Rb1cc1Q9ESK9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Rb1cc1Q9ESK9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms