Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ropn1Q9ESG2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms