Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OtofQ9ESF1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
OtofQ9ESF1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms