Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms