Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms