Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Wdr61Q9ERF3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms