Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Capn12Q9ER56 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Capn12Q9ER56 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms