Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Stx12Q9ER00 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Stx12Q9ER00 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms