Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Rapgef4Q9EQZ6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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Rapgef4Q9EQZ6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Rapgef4Q9EQZ6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Rapgef4Q9EQZ6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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Rapgef4Q9EQZ6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Rapgef4Q9EQZ6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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