Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU5

Set, Protein SET, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetQ9EQU5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SetQ9EQU5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SetQ9EQU5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms