Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQQ2

Yipf5, Protein YIPF5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf5Q9EQQ2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Yipf5Q9EQQ2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Yipf5Q9EQQ2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms