Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rpgrip1Q9EPQ2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms